Le Parc national Pongara est situé à l’est de la forêt du bassin du Congo, sur les berges méridionales de l’estuaire du Gabon. Le site comprend une large gamme de mangroves et de types forestiers riverains, marécageux, littoraux et inondés et de savanes herbacées. Il y a plusieurs rivières, (Remboué, Igombiné et Gomgoué, notamment). C’est un lieu de ponte important pour la tortue luth (Dermochelys coriacea) en danger critique et il abrite la tortue imbriquée (Eretmochelys imbricata) en danger critique, la tortue verte (Chelonia mydas) en danger et la tortue olivâtre (Lepidochelys olivacea) vulnérable, ainsi que des gorilles, des éléphants et d’importantes populations d’oiseaux migrateurs et environ 10 000 échassiers du Paléarctique hivernants. Les espèces de plantes telles que les arbres de la mangrove (Avicennia et Rhizophora) et la fougère dorée Acrostichum aureum aident à réguler et stabiliser le flux de l’eau. Le site est habité depuis le Néolithique et l’on y trouve aujourd’hui des communautés Fang, Benga et Sekiani. Les habitants exploitent le bois des forêts et pratiquent la chasse, la culture de la banane, du manioc et du poivre, et plus particulièrement la pêche – le site est considéré comme une source alimentaire pour toute la région. Toutefois, la pêche non sélective, la chasse et l’exploitation des forêts à l’intérieur et autour du site exercent une menace sur l’équilibre de l’écosystème. La Commission nationale des parcs nationaux a mené des activités de sensibilisation et un plan de gestion est appliqué depuis 2007.