Ce site comprend le dernier secteur du fleuve Choapa et sa vaste lagune estuarienne. Ses écosystèmes côtiers divers – plages, étendues de terres, dunes de sable et cours d’eau – abritent une riche biodiversité avec 148 espèces d’oiseaux, dix espèces de reptiles, quatorze espèces de mammifères, quatre espèces d’amphibiens et 133 espèces végétales. Certaines espèces sont menacées ou en danger, comme la loutre marine (Lontra felina), le crapaud chilien (Calyptocephalella gayi) et le cactus Eriosyce chilensis. Le site accueille aussi 28 espèces d’oiseaux migrateurs qui viennent s’y nourrir, y faire escale ou hiverner. Les oiseaux résidents en font une zone d’agrégation après la reproduction. Les poissons et les crustacés qui soutiennent l’économie locale, par exemple Mugil cephalus et Cryphiops caementarius une crevette d’eau douce endémique, se reproduisent dans le site. L’introduction de la carpe commune (Cyprinus carpio), une espèce envahissante, menace le site, de même que le recours à des méthodes agricoles de plus en plus techniques avec, notamment, l’utilisation non réglementée de pesticides. Les activités minières et les changements climatiques sont aussi au nombre des menaces.