El humedal Agusalu-Puhatu forma parte del mayor sistema de turberas de tipo mire de Estonia y consta de turberas de transición y de otros tipos rodeadas de bosques de coníferas y bosques aluviales. Su paisaje es característico por las franjas de colinas arenosas, conocidas localmente como “kriivas”, que forman islas de bosques y turba que sobresalen de la turbera. Agusalu es importante por mantener la diversidad biológica de la región biogeográfica gracias a sus hábitats variados. La zona ofrece importantes lugares de cría para varias especies de aves en peligro como el gallo lira común (Lyrurus tetrix), el lagópodo común (Lagopus lagopus) y el colimbo ártico (Gavia arctica). También es un refugio importante para especies cuyos requerimientos de hábitat son grandes, como el oso pardo (Ursus arctos), el lobo (Canis lupus), el alce (Alces alces), la nutria europea (Lutra lutra) y el lince boreal (Lynx lynx). Debido a su régimen de manejo y protección, la zona no se frecuenta pero la intensificación de las actividades de silvicultura y desecación en las zonas aledañas representa una amenaza.