El sitio Ramsar se encuentra totalmente comprendido dentro del Paisaje Protegido Laguna de Rocha. Forma parte del sistema lacustre de la costa atlántica que se caracteriza por comunicarse con el Océano Atlántico a través de un sistema dinámico de apertura y cierre de barras arenosas, que contribuye a la alta productividad y biodiversidad del sitio. Laguna de Rocha alberga 220 especies de aves, 29 de anfibios, 40 de reptiles, 46 de peces y 42 especies de mamíferos, entre los que se encuentran especies emblemáticas como el carpincho y la nutria. Además tiene un rol importante como parte de la ruta migratoria de diversas especies y constituye un área de nidificación de diversas especies de aves residentes. También destaca la presencia de especies de crustáceos de importancia comercial, como el camarón rosado y el cangrejo sirí. Las principales amenazas a la integridad ecológica del sitio incluyen la alteración del régimen hidrológico causadas por la apertura artificial de la barra arenosa (para evitar inundaciones en zonas aledañas y para beneficiar la pesca local), la eutrofización causada por los aportes de materia orgánica desde tierras altas y la urbanización descontrolada.