Este sitio es un gran lago somero de agua dulce que representa la mayor masa de agua dulce del país. Su comunicación con el mar de Wadden se cortó por la presa y autopista de Afsluitdijk en 1932 y se ganó al mar aproximadamente el 45 % del territorio como pólderes. En 2014 se modificaron los límites del sitio para hacerlos coincidir con los del sitio Natura 2000, incrementándose la superficie en 5184 hectáreas. El sito alberga periódicamente más de 20 000 aves acuáticas invernantes y también especies de aves en peligro como el combatiente (Philomachus pugnax), el avetoro común (Botaurus stellaris), la avoceta (Recurvirostra avosetta) y la polluela pintoja (Porzana porzana). IJsselmeer desempeña una función crucial en la regulación de la hidrología de la parte septentrional de los Países Bajos. La construcción de un innovador “río para la migración de los peces” en el dique Afsluitdijk entre IJsselmeer y el mar de Wadden comenzó en noviembre de 2020 y está previsto que restaure las condiciones salobres. Las principales actividades humanas son el turismo, la pesca comercial y el tráfico de buques. El sitio está amenazado por la gestión artificial del nivel del agua, la pesca comercial intensiva, la industrialización, la urbanización y la construcción de parques eólicos.