El delta interior del río Niger es un humedal inmenso de importancia ecológica que se extiende desde Ké Macina hasta Tombuctú y abarca las regiones de Ségou, Mopti y Tombuctú de Malí. El Sitio alberga especies consideradas vulnerables mundialmente, tales como el hipopótamo (Hippopotamus amphibius) y el manatí de África Occidental (Trichechus senegalensis). También alberga diversas especies de peces, entre ellas, los peces tigre (Hydrocynus brevis) y (Hydrocynus forskahlii), y la perca del Nilo (Lates niloticus), así como aves acuáticas amenazadas como la grulla coronada (Balearica pavonina). El Sitio tiene una función crucial en la regulación de las crecidas, la filtración de aguas y la provisión de recursos alimentarios y no alimentarios a las comunidades locales. Además, es vital para la agricultura, la pesca y el pastoreo de ganado y contribuye de forma significativa a los medios de subsistencia locales. El Sitio también es de importancia cultural, al servir como fuente de inspiración artística y albergar restos prehistóricos. Sin embargo, se enfrenta a considerables amenazas debido a los cambios en los ciclos de inundaciones del río Niger, provocados por el cambio climático y la mala gestión del agua río arriba. La sobrepesca y la expansión de la agricultura son las causas principales de la deforestación y han provocado un agotamiento de los recursos, además de conflictos entre las poblaciones locales.