El sitio se encuentra en la frontera oriental de Burkina Faso con Benin y limita con el Parc National de la Pendjari, en Benin, por el sur, y Singou Reserve, en Burkina Faso, por el oeste. Forma parte de la zona silvestre más importante de Burkina Faso y comprende una gran variedad de hábitats, desde los bosques de galería de los ríos Arly y Pendjari a la sabana arbolada y las colinas de arenisca de la cadena de Gobnangou. Sus ríos estacionales y llanuras de inundación albergan la mayor concentración de fauna silvestre del país. En este parque nacional habitan elefantes, leones, búfalos, facóqueros (Phacochoerus africanus) y distintas especies de antílope. Las charcas estacionales que salpican el paisaje de las llanuras son frecuentadas por una gran variedad de aves, tales como garzas, cigüeñas y patos. A lo largo del río Pendjari, las palmeras del género Borassus interrumpen las llanuras y forman palmerales que proporcionan un hábitat para aves como la paloma de Guinea (Columba guinea). Las colinas, rocas y formaciones de costras lateríticas proporcionan un hábitat importante para los guepardos y las aves rapaces. Las colinas también contribuyen a los valores paisajísticos del sitio.