El lago Nakuru es muy poco profundo y muy alcalino, con bosques y praderas circundantes alimentados por cuatro ríos estacionales y el Ngosur, un río perenne. Diversos ecosistemas, como pantanos de juncos, praderas inundadas estacionalmente y secas, bosques inundables y varios tipos de matorrales, albergan algunas especies de mamíferos amenazadas a escala mundial, como el rinoceronte negro africano (Diceros bicornis), en peligro crítico, y el hipopótamo común (Hippopotamus amphibius), considerado vulnerable, y especies de aves amenazadas a escala regional, como la aninga africana (Anhinga rufa) y la garceta grande (Ardea alba). El lugar alberga una gran población de flamenco enano (Phoeniconaias minor). La introducción de la especie de pez Oreochromis grahami en el lago en la década de 1960 atrajo a otros consumidores secundarios, entre ellos varias especies de aves piscívoras. También se ha producido una introducción accidental de Oreochromis nilotica que aumentó el número de especies de aves piscívoras de agua dulce. El turismo es la principal actividad dentro del Sitio y atrae anualmente a más de 300.000 visitantes nacionales y extranjeros. Las amenazas dentro del parque incluyen especies vegetales invasoras y vallados que impiden la migración de animales, mientras que las amenazas dentro de la cuenca del lago incluyen la expansión de la ciudad de Nakuru y actividades forestales y agrícolas que degradan la calidad del agua y aumentan la erosión y la sedimentación.