Le site appartient à une vaste zone de nature sauvage du nord‑ouest de l’Estonie, Leidissoo se compose de différents types et habitats de tourbières d’intérêt européen et joue un rôle important dans l’équilibre hydrologique de la région. Les fagnes ouvertes sont prédominantes tandis que, dans la partie ouest du site, on trouve aussi des communautés de tourbières. Leidissoo est un des rares habitats d’Estonie restés à l’état naturel et non drainés, de sorte que la zone humide abrite des plantes et des animaux importants pour la région biogéographique. On y trouve de nombreuses espèces d’oiseaux inscrites à l’Annexe I de la Directive Oiseaux européenne, notamment la cigogne noire (Ciconia nigra), le râle des genêts (Crex crex) et le tétras lyre (Lyrurus tetrix), tandis que le site sert de lieu de nidification pour des espèces telles que la bécassine des marais (Gallinago gallinago), dont on a recensé 200 couples. On pratique une cueillette traditionnelle des baies et des champignons ainsi qu’une chasse à petite échelle. Les menaces comprennent l’intensification de la foresterie et le drainage des zones environnantes.