Le Site est une vasière peu profonde à fort marnage, régulée par les flux hydrologiques associés aux marées. Il jouxte une zone lagunaire unique à Mayotte, à forte valeur patrimoniale et écologique : c’est un écosystème très productif et diversifié, servant de refuge, de lieu de reproduction et d’alimentation à de nombreux oiseaux d’eau et de mer, ainsi qu’à des juvéniles de poissons et de tortues, entre autres. On y trouve la tortue imbriquée (Eretmochelys imbricata imbricata), espèce En danger critique d’extinction, et la tortue verte (Chelonia mydas), espèce En danger. Il s’agit d’un Site d’importance internationale pour la migration de la sterne voyageuse (Thalasseus bengalensis), ainsi que pour la présence de plusieurs espèces endémiques aux Comores et à Madagascar telles que le héron de Humblot (Ardea humbloti), classé En danger, et la mygale intertidale (Idioctis intertidalis) qui vit dans la zone intertidale. La vasière est écologiquement sensible et joue un rôle important de réceptacle et purificateur des effluents terrestres et urbains, en filtrant l’eau avant qu’elle n’atteigne le lagon et en réduisant la sédimentation terrigène pouvant l’affecter. Parmi les menaces pesant sur le Site, on peut citer l’envasement, l’érosion côtière et le développement urbain.