Le lac Magui est une importante dépression du bassin de Térékolé-Kolimbiné, alimentée par les rivières Térékolé, Djéli Mahé et Kolimbiné. L’ensemble de ce système de bassin alimente le lac. La végétation entourant le lac est fortement dégradée et dominée par des épineux. Le paysage se caractérise par une savane arbustive et une végétation continentale clairsemée, toutes deux gravement affectées par les activités humaines. Malgré les pressions environnementales, les arbres de la savane persistent le long du lac. Le site accueille des oiseaux d’eau, dont le bécasseau variable (Calidris alpina) et le jacana à poitrine dorée (Actophilornis africanus). Bien que les grandes populations d’espèces sauvages aient décliné en raison des variations climatiques et des pressions humaines intenses, le site reste une halte importante pour les oiseaux qui migrent vers le delta intérieur du Niger. Au fil des ans, la croissance démographique et les pratiques agricoles, halieutiques, cynégétiques et pastorales non durables ont considérablement perturbé l’équilibre écologique de la région. Les sécheresses ont réduit la productivité des plantes et l’écoulement de l’eau jusqu’au lac. En outre, les communautés à la recherche de zones humides fertiles ont largement exploité les basses terres, les lits des cours d’eau et les marais temporaires, ce qui a encore aggravé la dégradation de l’environnement.