Avec ses plus de 12 millions d’hectares, le site de Rio Negro, comprend le plus grand affluent septentrional de l’Amazone et plus de 20 unités de conservation ainsi que des territoires autochtones. Situé au cœur de l’une des plus vastes forêts tropicales humides protégées de la planète, le site possède plusieurs écosystèmes typiques de la région tels que l’Igapo (forêts inondées-aux eaux noires), les savanes édaphiques, et les archipels fluviaux. La riche biodiversité de Rio Negro abrite des espèces animales menacées au plan mondial comme l’alapi lugubre (Myrmoborus lugubris), la loutre géante d’eau douce (Pteronura brasiliensis), le tamarin bicolore (Saguinus bicolor) en danger critique d’extinction, l’atèle à ventre blanc (Ateles belzebuth), et des plantes telles que la noix du Brésil (Bertholletia excelsa). Les communautés locales qui résident dans le site sont ethniquement et culturellement diverses et les unités de conservation ont été créées pour soutenir leurs modèles durables d’utilisation des ressources et d’agriculture à faible impact. Le site contribue aussi à l’approvisionnement en eau d’au moins six municipalités brésiliennes et le cours principal du fleuve sert à la navigation, reliant les communautés entre elles. Avec la chasse et la pêche non contrôlées, la transformation des terres et le défrichement de la végétation sont parmi les principales menaces pour le site.