Naternaq est un des plus importants complexes de zones humides de l’ouest du Groenland ; il comprend une vaste plaine marécageuse, de nombreux lacs peu profonds et des ruisseaux en méandres. Le site abrite diverses communautés végétales luxuriantes – tapis denses de mousses, marais et landes naines. Parmi les espèces menacées au plan mondial, on peut observer le rorqual commun, l’harelde boréale et le caribou. C’est aussi un site important pour l’oie rieuse du Groenland (Anser albifrons flavirostris) en danger au plan national, car il abrite plus de 1,8% de la population en période de nidification et de mue, un pourcentage en diminution ces dernières années dans ce site qui accueillait autrefois 9% de cette population. Il n’y a pas d’établissements humains permanents mais il y a des activités de chasse de subsistance, chasse récréative et pêche le long de la côte et à l’intérieur des terres. Par ailleurs, d’autres activités de tourisme comme la randonnée, le kayak et la construction de huttes de vacance sont en plein essor et considérées comme d’éventuelles menaces pour le site.