Le Parque Nacional Jeanette Kawas est essentiellement composé de zones humides marines et côtières, y compris l’un des écosystèmes de mangroves les mieux préservés du nord du Honduras. En 2021, le Honduras a agrandi sa superficie de 78 150 à 79 382,16 hectares. Le site est représentatif des Caraïbes honduriennes et sert de refuge à une grande diversité d’espèces aquatiques et terrestres ; on y trouve quatre espèces de la mangrove, notamment le palétuvier rouge (Rhizophora mangle) et le palétuvier blanc (Laguncularia racemosa). Le site est aussi un refuge pour des espèces menacées comme le mérou rayé (Epinephelus striatus), le corail corne d’élan (Acropora palmata), le lamantin des Caraïbes (Trichechus manatus), le crocodile américain (Crocodylus acutus) et la tortue cuir (Dermochelys coriacea). Les principales menaces pour les écosystèmes du site, en particulier les récifs coralliens, comprennent le déboisement, l’érosion et la pollution par les ordures et les polluants chimiques déversés dans l’espace marin de la zone humide.