El Sitio se encuentra en las tierras altas del centro y sudeste de Angola, dentro de la región biogeográfica del Zambeze. Forma una importante cuenca hidrográfica y alimenta sistemas fluviales que sustentan humedales aguas abajo, como el delta del Okavango y la llanura de inundación del Zambeze. La hidrología del sitio está determinada por suelos arenosos profundos que filtran el agua de lluvia, por lo que presenta arroyos claros de bajo contenido de minerales. Este sistema de aguas subterráneas sustenta extensos bosques de miombo y turberas en una superficie más de 110.000 km². La zona alberga la planta carnívora Genlisea angolensis, una especie en peligro y casi endémica, además de especies de fauna raras y amenazadas como el guepardo (Acinonyx jubatus), el león (Panthera leo) y el licaón (Lycaon pictus), así como el antílope negro gigante (Hippotragus niger ssp. variani), que se encuentra en peligro crítico. El Sitio alberga una diversidad excepcional de especies de agua dulce, con más de 18 especies de peces endémicas o casi endémicas, varias de las cuales pueden ser nuevas para la ciencia. También es una importante zona de desove del pez tigre goliat (Hydrocynus vittatus), una especie migratoria. El Sitio Lisima Lya Mwono desempeña un papel fundamental en la salvaguardia de la biodiversidad y el mantenimiento de sistemas hidrológicos de importancia regional y mundial. La extracción de agua y el desarrollo para fines no especificados constituyen amenazas actuales para sus características ecológicas.