El lago Balaton es el mayor lago de agua dulce de Europa Central. A lo largo de sus orillas hay praderas pantanosas y amplios carrizales. El lago alberga poblaciones grandes de especies de flora y fauna esenciales para mantener la diversidad biológica de la región biogeográfica panónica. Durante las temporadas de migración e invernada, el sitio es una zona de descanso importante para más de 30.000 patos, gansos y fochas, incluyendo más del 1 % de las poblaciones invernantes de varias especies.  Las aguas del Balaton albergan unas 1.400 especies de algas y proporcionan zonas importantes de desove y cría para peces.  El sitio es el único refugio del sureste de Europa del escarabajo acuático de las hojas (Macroplea mutica). Las actividades tradicionales humanas incluyen la pesca y la extracción de carrizo. El lago también es una zona recreativa popular. Hay 12 centros de información y más de 20 senderos naturales alrededor del lago. Las principales amenazas para las características ecológicas del sitio están relacionadas con el desarraigo de carrizos, la construcción de puertos deportivos y muelles pesqueros, la práctica de deportes de motor y los terraplenes ilegales. La calidad del agua del lago ha mejorado a lo largo de los últimos 20 años debido a la disminución significativa del nivel de eutrofización. El Plan de gestión de la cuenca hidrográfica de Balaton fue aprobado en 2010.