Le lac Balaton est le plus grand lac d’eau douce d’Europe centrale et ses berges sont bordées de prairies marécageuses et de vastes roselières. Le lac abrite de grandes populations de plantes et d’animaux importants pour le maintien de la diversité biologique de la région biogéographique pannonienne. Durant les saisons de migration et d’hivernage, le site est une étape importante pour plus de 30,000 canards, oies et foulques, et plus de 1% des populations européennes hivernantes de plusieurs de ces espèces. Les eaux du lac Balaton entretiennent environ 2000 espèces d’algues et servent de frayère et de zone de croissance aux poissons. Le site est le seul refuge pour la chrysomèle Macroplea mutica dans le sud-est de l’Europe. Parmi les activités traditionnelles, on peut citer la pêche et la récolte des roseaux. C’est une destination populaire pour les loisirs en Europe centrale et l’on trouve 12 centres d’information et plus de 20 sentiers-nature autour du lac. Les principales menaces pour les caractéristiques écologiques du site concernent la récolte non durable des roseaux, la construction de ports de plaisance et de cabanes de pêche, la pratique de sports motorisés et l’eutrophisation causée par l’utilisation d’engrais. Depuis 20 ans, la qualité de l’eau du lac s’est améliorée, le taux d’eutrophisation ayant diminué de manière significative. Le Plan de gestion de l’eau du bassin du lac Balaton a été approuvé en 2010.