Le site se compose d’une lagune côtière faite de mangroves, de marais, de vasières et de marais salants, et d’un groupe de « tómbolos » (îlots) situés à l’intérieur de la Zone de protection de la flore et de la faune des îles du golfe de Californie. Il s’agit d’une importante zone d’hivernage, d’alimentation et de reproduction pour des espèces sauvages protégées au niveau national et international. Cette zone humide abrite l’aire de nidification la plus septentrionale de la spatule rosée (Platalea ajaja) le long de la côte nord du Pacifique. À l’embouchure de la lagune, on a pu y observer la présence de grands dauphins (Tursiops truncatus) et d’otaries de Californie (Zalophus californianus) affichant un comportements transitionnel, de repos ou d’alimentation. Cette zone humide constitue un lieu d’alimentation et de refuge pour la tortue verte (Chelonia mydas), une espèce menacée à l’échelle mondiale ; elle abrite également l’acoupa de MacDonald, (Totoaba macdonaldi), une espèce de poisson gravement menacée. On y trouve deux des quatre espèces de mangroves présentes au Mexique : le palétuvier rouge (Rhizophora mangle) et le palétuvier noir (Avicenia germinans). Elle offre une large éventail de services écosystémiques, dont beaucoup sont essentiels à la subsistance des communautés locales, qui pratiquent la pêche et l’ostréiculture. Le braconnage et la pêche intensive constituent une menace en raison de la surexploitation d’espèces comme les crabes (Callinectes spp.) et de la capture de tortues de mer (Chelonia mydas). En 2025, un plan de gestion était à l’étude et des discussions étaient en cours avec les parties prenantes locales et les autorités municipales pour établir une stratégie visant à réduire les déversements de déchets solides.