Le Site présente une diversité d’habitats, notamment des lacs de dunes, des mangroves, des zones intertidales et des marais. Il abrite la plus grande mangrove de la région, avec sept espèces de mangroves répertoriées qui constituent un habitat essentiel pour les poissons et les oiseaux. Il renferme également une biodiversité exceptionnelle. Les espèces de mammifères comprennent le propithèque de Verreaux (Propithecus verreauxi), classé En danger critique, le lémur catta (Lemur catta), classé En danger, et le lémurien brun (Eulemur fulvus), classé Vulnérable. Les espèces d’oiseaux dont la conservation est préoccupante comprennent le héron de Humblot (Ardea humbloti), classé En danger, et le gravelot de Madagascar (Charadrius thoracicus), classé Vulnérable. Les zones humides servent également de zones de reproduction et de nidification pour les oiseaux d’eau migrateurs tels que le bécasseau cocorli (Calidris ferruginea) et le chevalier aboyeur (Tringa nebularia). Près de 90 % de la population locale dépend du Site pour l’approvisionnement en eau, la pêche, l’agriculture et d’autres activités de subsistance.