Le Site est la plus grande zone humide continentale du pays et l’une des plus vastes d’Amérique centrale. Sa situation, à la convergence de systèmes d’eau douce et d’eau salée et de deux régions biogéographiques, favorise une biodiversité exceptionnelle et une grande variété d’écosystèmes, notamment des mangroves, des marécages et des cours d’eau saisonniers et permanents. La zone humide constitue un habitat essentiel pour le poisson-scie commun (Pristis pristis), en danger critique d’extinction, ainsi que pour de nombreuses espèces vulnérables telles que le pécari à lèvres blanches (Tayassu pecari), le grand hocco (Crax rubra), la harpie féroce (Harpia harpyja) et le crocodile d’Amérique (Crocodylus acutus). Elle abrite également des populations de félins sauvages inscrits à l’Annexe I de la CITES, notamment l’ocelot (Leopardus pardalis) et le jaguarondi (Herpailurus yagouaroundi). Le Site joue un rôle crucial dans la protection des communautés voisines contre les inondations, car il absorbe l’excès d’eau lors des grandes marées et des fortes pluies. Il sert également de frayère et de nurserie pour des espèces de poissons ayant une importance commerciale, telles que le mâchoiron besudo (Cathorops tuyra), le crossie serran (Centropomus unionensis) et l’acoupa reine (Cynoscion albus), qui sont une source de nourriture et de revenus pour les communautés locales. Outre son importance écologique, la zone humide est également utilisée pour la recherche scientifique, l’écotourisme et les traditions culturelles préservées par le peuple Emberá et les communautés afrodescendantes.