Le site est constitué de plusieurs aires protégées et zones humides associées, dont le Parc national sous-marin de Montecristi, les zones humides de Buen Hombre, la réserve de faune sauvage de Cayos Siete Hermanos, la zone de mangrove d’Estero Balsa et la lagune Saladilla. Il renferme tout un éventail d’écosystèmes, dont des lagunes, des mangroves, des marais, des estuaires, des marécages, des forêts arbustives sèches et des récifs coralliens, une grande partie de ces récifs figurant parmi les plus représentatifs de République dominicaine. Il abrite également une population considérable d’espèces menacées de tortues marines dont la tortue imbriquée (Eretmochelys imbricata) et la tortue verte (Chelonia mydas). En outre, quatre importantes espèces d’oiseaux utilisent cette zone humide pour nicher : le noddi brun (Anous stolidus), la sterne fuligineuse (Onychoprion fuscatus), la sterne caugek (Thalasseus sandvicensis) et la sterne bridée (Onychoprion anaethetus). Le site constitue pour les communautés locales une source d’eau potable et de nourriture, tout en favorisant la prévention des inondations, la recharge des nappes phréatiques et l’atténuation des effets du changement climatique. Les récifs coralliens et la mangrove abritent des ressources halieutiques qui offrent des moyens d’existence à de nombreux habitants de la zone. Les menaces qui pèsent sur les caractéristiques écologiques du site sont principalement la régulation des cours d’eau et la canalisation, la prolifération d’espèces invasives, l’absence de gestion des déchets ménagers et solides, les effluents agricoles et sylvicoles et les épisodes de sécheresse.