Le site se trouve sur la frontière orientale entre le Burkina Faso et le Bénin. Adjacent au Parc national de la Pendjari au Bénin, au sud, et à la Réserve de Singou au Burkina Faso, à l’ouest, il fait partie de la zone de nature sauvage la plus importante du Burkina Faso et couvre une large gamme d’habitats, des forêts galeries des rivières Arly et Pendjari aux savanes boisées et aux collines de grès de la chaîne de Gobnangou. Les rivières saisonnières et les plaines d’inondation accueillent les plus grandes concentrations d’animaux sauvages du pays. Le Parc national d’Arly abrite des éléphants, des lions, des buffles et des phacochères Phacochoerus africanus ainsi que différentes espèces d’antilopes. Les mares saisonnières qui parsèment les plaines sont fréquentées par une grande diversité d’oiseaux, notamment des grands hérons, des cigognes et des canards. Le long de la rivière Pendjari, le palmier Borassus forme des bosquets qui servent d’habitat à des oiseaux tels que le pigeon roussard Columba guinea. Les formations de collines, de rochers et de la cuirasse latéritique sont des habitats importants pour le guépard et les rapaces. Les collines renforcent également la beauté du paysage du site.